El edificio en donde funciona el Colegio del Huerto fue construido en el año 1901, y la obra estuvo a cargo de Carlos Trincavelli. Tiene un estilo neoclásico italiano, con líneas puras propias del uso institucional del mismo. 

El establecimiento educativo comenzó a funcionar en 1897, ocupando inicialmente un inmueble situado en calle Merced entre Avenida Julio A. Roca (hoy Avenida de Mayo) y Pueyrredón. No había pasado un año de su inauguración, cuando aquel local resultó pequeño. Así, en febrero de 1898 se trasladó a un inmueble mucho más amplio ubicado en calle San Nicolás entre San Martín y Dorrego. 

Al poco tiempo el colegio cobró una real importancia en el terreno de la educación en Pergamino y sus alrededores, fue creciendo día a día y con ello la necesidad de ampliarlo, razón por la cual se adquirió el inmueble que ocupa actualmente, frente a la plaza principal.